截至2020年，门头沟区共有医疗卫生机构266个，其中医院12个。医疗卫生机构实有床位2989张，其中医院2494张。卫生技术人员3835人，其中，执业（助理）医师1389人，注册护士1608人，药师（士）253人，技师（士）236人。卫生医疗机构总诊疗量340.4万人次，出院人数43944人。